MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus ATCC 8530 chromosome

Total Repeats: 46345

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017491	GTG	2	6	347	352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385833939
2	NC_017491	TCA	2	6	393	398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385833939
3	NC_017491	GCATCA	2	12	430	441	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385833939
4	NC_017491	CGATGA	2	12	448	459	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385833939
5	NC_017491	CAA	2	6	464	469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385833939
6	NC_017491	CGG	2	6	555	560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385833939
7	NC_017491	TTTA	2	8	605	612	25 %	75 %	0 %	0 %	385833939
8	NC_017491	CGG	2	6	613	618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385833939
9	NC_017491	AAT	2	6	674	679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385833939
10	NC_017491	TCCA	2	8	737	744	25 %	25 %	0 %	50 %	385833939
11	NC_017491	TGA	2	6	802	807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385833939
12	NC_017491	TTC	2	6	815	820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385833939
13	NC_017491	AAG	2	6	828	833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385833939
14	NC_017491	AAG	2	6	840	845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385833939
15	NC_017491	TTC	2	6	848	853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385833939
16	NC_017491	GCCT	2	8	909	916	0 %	25 %	25 %	50 %	385833939
17	NC_017491	CCG	2	6	986	991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385833939
18	NC_017491	AGA	2	6	1036	1041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385833939
19	NC_017491	GAA	2	6	1147	1152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385833939
20	NC_017491	CGA	2	6	1204	1209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385833939
21	NC_017491	GA	3	6	1347	1352	50 %	0 %	50 %	0 %	385833939
22	NC_017491	A	6	6	1428	1433	100 %	0 %	0 %	0 %	385833939
23	NC_017491	ACC	2	6	1448	1453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385833939
24	NC_017491	GCT	2	6	1861	1866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385833940
25	NC_017491	GCA	2	6	1892	1897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385833940
26	NC_017491	GC	3	6	1918	1923	0 %	0 %	50 %	50 %	385833940
27	NC_017491	TTC	2	6	1924	1929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385833940
28	NC_017491	AAC	2	6	2044	2049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385833940
29	NC_017491	CGTTGC	2	12	2205	2216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385833940
30	NC_017491	CAG	2	6	2258	2263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385833940
31	NC_017491	CAT	3	9	2283	2291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385833940
32	NC_017491	TAT	2	6	2375	2380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385833940
33	NC_017491	AGC	2	6	2536	2541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385833940
34	NC_017491	CGT	2	6	2547	2552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385833940
35	NC_017491	GAA	2	6	2623	2628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385833940
36	NC_017491	CAA	2	6	2640	2645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385833940
37	NC_017491	GCA	2	6	2972	2977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385833941
38	NC_017491	ATG	2	6	3041	3046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385833941
39	NC_017491	ATAG	2	8	3058	3065	50 %	25 %	25 %	0 %	385833941
40	NC_017491	CGA	3	9	3684	3692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385833942
41	NC_017491	CAC	2	6	3709	3714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385833942
42	NC_017491	TGAT	2	8	3756	3763	25 %	50 %	25 %	0 %	385833942
43	NC_017491	GCG	2	6	3765	3770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385833942
44	NC_017491	CGT	2	6	3830	3835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385833942
45	NC_017491	GAT	2	6	3854	3859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385833942
46	NC_017491	A	6	6	3924	3929	100 %	0 %	0 %	0 %	385833943
47	NC_017491	GCAAG	2	10	3999	4008	40 %	0 %	40 %	20 %	385833943
48	NC_017491	GC	3	6	4045	4050	0 %	0 %	50 %	50 %	385833943
49	NC_017491	CAA	2	6	4062	4067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385833943
50	NC_017491	GC	3	6	4102	4107	0 %	0 %	50 %	50 %	385833943
51	NC_017491	ATT	2	6	4156	4161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385833943
52	NC_017491	TCA	2	6	4164	4169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385833943
53	NC_017491	GATCG	2	10	4189	4198	20 %	20 %	40 %	20 %	385833943
54	NC_017491	TTTG	2	8	4242	4249	0 %	75 %	25 %	0 %	385833943
55	NC_017491	CGG	2	6	4294	4299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385833943
56	NC_017491	GGC	2	6	4455	4460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385833943
57	NC_017491	TGC	2	6	4496	4501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385833943
58	NC_017491	TGC	3	9	4518	4526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385833943
59	NC_017491	CAA	2	6	4531	4536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385833943
60	NC_017491	AGC	2	6	4649	4654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385833943
61	NC_017491	GAT	2	6	4702	4707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385833943
62	NC_017491	CAG	2	6	4759	4764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385833943
63	NC_017491	CAC	2	6	4767	4772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385833943
64	NC_017491	GAC	3	9	4926	4934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385833943
65	NC_017491	ATC	2	6	4960	4965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385833943
66	NC_017491	AAGA	2	8	5060	5067	75 %	0 %	25 %	0 %	385833944
67	NC_017491	GAA	2	6	5075	5080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385833944
68	NC_017491	AAGA	2	8	5081	5088	75 %	0 %	25 %	0 %	385833944
69	NC_017491	GCA	2	6	5096	5101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385833944
70	NC_017491	ATG	2	6	5106	5111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385833944
71	NC_017491	CAT	2	6	5198	5203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385833944
72	NC_017491	TTGAAG	2	12	5265	5276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385833944
73	NC_017491	GTC	2	6	5349	5354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385833944
74	NC_017491	GGT	2	6	5390	5395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385833944
75	NC_017491	TGGCGG	2	12	5401	5412	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	385833944
76	NC_017491	CGG	2	6	5425	5430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385833944
77	NC_017491	GTT	2	6	5489	5494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385833944
78	NC_017491	CGG	2	6	5497	5502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385833944
79	NC_017491	GAGCAT	2	12	5573	5584	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385833944
80	NC_017491	CCGGAT	2	12	5606	5617	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385833944
81	NC_017491	TGA	2	6	5641	5646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385833944
82	NC_017491	GCG	2	6	5723	5728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385833944
83	NC_017491	GGC	2	6	5759	5764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385833944
84	NC_017491	GAA	3	9	5791	5799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385833944
85	NC_017491	CTG	2	6	5807	5812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385833944
86	NC_017491	GAT	2	6	6020	6025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385833944
87	NC_017491	GTT	2	6	6065	6070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385833944
88	NC_017491	AGACCA	2	12	6105	6116	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385833944
89	NC_017491	GGT	2	6	6142	6147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385833944
90	NC_017491	CAA	2	6	6172	6177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385833944
91	NC_017491	ATT	2	6	6212	6217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385833944
92	NC_017491	GCT	2	6	6251	6256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385833944
93	NC_017491	AAG	2	6	6281	6286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385833944
94	NC_017491	ACA	2	6	6327	6332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385833944
95	NC_017491	GGC	2	6	6386	6391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385833944
96	NC_017491	GAA	2	6	6494	6499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385833944
97	NC_017491	ATC	2	6	6578	6583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385833944
98	NC_017491	CCGATG	2	12	6588	6599	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385833944
99	NC_017491	GTT	2	6	6622	6627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385833944
100	NC_017491	ATG	2	6	6722	6727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385833944
101	NC_017491	GCC	2	6	6775	6780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385833944
102	NC_017491	GCCA	2	8	6830	6837	25 %	0 %	25 %	50 %	385833944
103	NC_017491	ACC	2	6	6848	6853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385833944
104	NC_017491	CGG	2	6	6953	6958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385833944
105	NC_017491	GAA	2	6	6968	6973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385833944
106	NC_017491	TTG	2	6	6984	6989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385833944
107	NC_017491	AAC	2	6	6995	7000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385833944
108	NC_017491	GAT	2	6	7078	7083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385833945
109	NC_017491	ACGT	2	8	7184	7191	25 %	25 %	25 %	25 %	385833945
110	NC_017491	ATGA	2	8	7231	7238	50 %	25 %	25 %	0 %	385833945
111	NC_017491	AAG	2	6	7267	7272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385833945
112	NC_017491	TCG	2	6	7283	7288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385833945
113	NC_017491	TGACGG	2	12	7413	7424	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385833945
114	NC_017491	GCG	3	9	7426	7434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385833945
115	NC_017491	CAA	2	6	7491	7496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385833945
116	NC_017491	GATT	2	8	7503	7510	25 %	50 %	25 %	0 %	385833945
117	NC_017491	GTT	2	6	7546	7551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385833945
118	NC_017491	GC	3	6	7558	7563	0 %	0 %	50 %	50 %	385833945
119	NC_017491	CTG	2	6	7573	7578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385833945
120	NC_017491	ACC	2	6	7612	7617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385833945
121	NC_017491	CCG	2	6	7624	7629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385833945
122	NC_017491	ATC	2	6	7673	7678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385833945
123	NC_017491	CCA	2	6	7685	7690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385833945
124	NC_017491	CCG	2	6	7691	7696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385833945
125	NC_017491	GGT	2	6	7735	7740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385833945
126	NC_017491	TTA	2	6	7853	7858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385833945
127	NC_017491	CAA	2	6	7878	7883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385833945
128	NC_017491	TGG	2	6	7892	7897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385833945
129	NC_017491	GAAAA	2	10	7921	7930	80 %	0 %	20 %	0 %	385833945
130	NC_017491	TGA	2	6	7953	7958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385833945
131	NC_017491	CCG	2	6	7995	8000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385833945
132	NC_017491	AAT	2	6	8026	8031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385833945
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256	NC_017491	TGG	2	6	16554	16559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385833956
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500	NC_017491	CTTA	2	8	30749	30756	25 %	50 %	0 %	25 %	385833972

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